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母猪乳中的氨基酸不能被100%的消化，这是因为乳中两种主要的蛋白质类型即酪蛋白和乳清起不同的作用。对哺乳仔猪而言，酪蛋白被认为是日粮氨基酸的主要的来源(Hartmann and Holmes,1989)[21]。相反，乳清蛋白质包括几种免疫球蛋白，在常乳中IgA占优势。在人类婴儿的研究中已经证明人常乳中大约有20%的IgA未经消化而排泄。(Davidson和 Lonnerdal,1987; Prentice等， 1987)[22，23]。
乳清蛋白质富含胱氨酸、甘氨酸、苏氨酸;谷氨酸、脯氨酸和蛋氨酸的量比酪蛋白低(Heine 等， 1991)[24]。因此在乳清蛋白质中量多的氨基酸的消化率一定会比酪蛋白中量多丰富的氨基酸的消化率低。实际上，胱氨酸、甘氨酸、苏氨酸的消化率分别为84%，87%和84%。而谷氨酸、脯氨酸和蛋氨酸的消化率分别是100%，94%和99%。这证明了乳清蛋白质比酪蛋白消化率低。
相对于Fuller(1994)和NRC(1998)[25，26]提出的用于蛋白质沉积(即生长)的理想氨基酸的比例，母猪乳中苏氨酸和色氨酸似乎都有点少。不过，这就提出了一个原则性的问题， 是否母猪乳中含量相对较高的赖氨酸量实际上超过了哺乳仔猪达到最佳蛋白质沉积所需的赖氨酸量。证据是14天大的仔猪对赖氨酸的需要量较高(Dunshea 等， 2000)[27]，这可以表明母猪乳中赖氨酸的量高是非常有道理的。
如果认为母猪乳中可消化的氨基酸成分是估计哺乳仔猪理想氨基酸特性的理想基础，那么可以认为Fuller(1994)和NRC(1998)[25，26]提出的用于蛋白质沉积的理想氨基酸的比例中，对苏氨酸和色氨酸的需要量估计过高。
猪乳中含有的可消化精氨酸大概是可消化赖氨酸的64.3% ,虽然这种赖氨酸：精氨酸的比率不会引起精氨酸和赖氨酸的拮抗(Edmonds等，1987) [14]，但问题在于哺乳仔猪是否能在肾中合成足够的精氨酸来弥补猪乳中显然缺乏的精氨酸。
Boyd 等 (1995) [1] 在人工喂养的研究基础上提出，新生仔猪的生物生长潜能至少比在母猪哺育情况下高74%，这种情况也许反映了蛋白质-氨基酸不足或能量不足。因此，我们应进行研究来确定猪乳中是否缺乏色氨酸、苏氨酸或精氨酸，以使出生后到21天的仔猪达到最佳的蛋白质沉积。
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