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1、和慢性呼吸道病的区别。慢呼是由于败血霉形体引起的，剖检时气囊内有黄色干酪物，使用泰乐和强力霉素后，可以得到很好的疗效。而流感用以上药物效果不明显。
2、和环境不良引起的大肠杆菌病相区别。当鸡舍环境不良时，会给鸡群造成较大的应激，使机体抵抗能力下降，导致慢呼和肠炎的发生，并因此继发大肠杆菌病。当鸡群一但感染禽流感H9病毒后，病毒在呼吸道黏膜上复制，造成黏膜的损伤，大肠杆菌就会乘虚而入，因此继发大肠杆菌病。
3、和高致病性禽流感相区别；高致病性禽流感表现在短时间内出现食欲废绝，体温骤升，精神高度沉郁，鸡冠发绀，头脸部水肿，伴随大批死亡，出现此临床症状时，不可给药治疗，应立即扑杀。
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